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¿Cómo se fabrican los péptidos? Síntesis y purificación

De la química en solución al soporte sólido de Merrifield, el ciclo Fmoc, el origen de las impurezas, la purificación por HPLC preparativa y lo que los contraiones suponen para el peso.

Actualizado el 14 de noviembre de 2026 · 6 minutos de lectura

Un péptido de investigación es un producto químico. Se construye aminoácido a aminoácido, se escinde de su soporte, se purifica y se seca. Conocer esa vía facilita la lectura de un certificado de análisis.

De la solución a un soporte sólido

Los primeros péptidos se fabricaron íntegramente en solución. Cada acoplamiento se realizaba por separado y cada intermedio se aislaba y purificaba. Así fabricó Vincent du Vigneaud la oxitocina a mediados de la década de 1950; en 1955 el comité Nobel lo calificó de primera síntesis de una hormona polipeptídica. Era un trabajo minucioso que podía llevar años por péptido.

En 1963 Robert Bruce Merrifield publicó «Solid Phase Peptide Synthesis. I. The Synthesis of a Tetrapeptide» en el Journal of the American Chemical Society. En él unió la cadena en crecimiento a una perla de polímero insoluble, el soporte o resina. En 1984 recibió por ello el Premio Nobel de Química, con la mención «for his development of methodology for chemical synthesis on a solid matrix». El comunicado de prensa de la Real Academia Sueca de Ciencias describe la idea central: como la cadena está anclada a un soporte insoluble, el material no deseado puede eliminarse sin más mediante lavado después de cada paso. El filtrado y el lavado sustituyen al aislamiento de cada intermedio. El mismo comunicado de prensa cita como hito que en 1969 se fabricó en el laboratorio de Merrifield la enzima ribonucleasa.

El ciclo de síntesis

La cadena crece desde el extremo C-terminal, que está unido al soporte. A partir de ahí, la misma secuencia de pasos se repite para cada aminoácido:

  1. Desprotección. Se retira el grupo protector temporal del último aminoácido añadido, con lo que el grupo amino vuelve a quedar libre.
  2. Acoplamiento. El siguiente aminoácido se añade en forma activada y forma un enlace peptídico. Sus cadenas laterales siguen protegidas para que no puedan reaccionar.
  3. Lavado. El exceso de reactivo y los subproductos se eliminan por lavado; el péptido permanece en el soporte.

Los grupos protectores utilizados definen la vía. La revisión de Behrendt, White y Offer (Journal of Peptide Science, 2016) afirma que la síntesis de péptidos en fase sólida Fmoc es hoy el método de elección. Fmoc designa el grupo fluorenilmetiloxicarbonilo, que se retira del grupo amino con una base; en esa vía las cadenas laterales llevan grupos terc-butilo, de ahí el nombre Fmoc/tBu. La vía más antigua se llama Boc/Bzl, por los grupos terc-butiloxicarbonilo y bencilo. La diferencia no es académica: la base necesaria en cada ronda Fmoc causa también la principal reacción secundaria de esta química.

El origen de las impurezas

La misma revisión califica la formación de aspartimida como la reacción secundaria más grave de la química Fmoc. Se produce cuando una secuencia que contiene ácido aspártico se expone a una base fuerte y, según los autores, es un problema especial en péptidos largos y en secuencias con varios residuos de ácido aspártico. BPC-157 es un ejemplo de una secuencia así: lleva dos ácidos aspárticos contiguos, en las posiciones 10 y 11. La revisión trata también la racemización, el paso de un aminoácido a su forma especular.

Además, se forman cadenas en las que falta un aminoácido, porque un acoplamiento no se completó, y cadenas que se detienen demasiado pronto. Todos esos subproductos se parecen al propio producto. Aparecen como picos adicionales en el cromatograma y como masas inesperadas en el espectro de masas. Véanse ¿Qué significa una pureza del 99 %? y Cómo leer un espectro de masas.

Escisión del soporte

Una vez completa la cadena, el péptido se escinde del soporte y se retiran los grupos protectores permanentes de las cadenas laterales. En la vía Fmoc/tBu esto se hace con un ácido. Lo que queda es un péptido bruto: el producto previsto, más los subproductos de la síntesis.

Purificación

El material bruto pasa por HPLC preparativa en fase inversa. Es la misma separación que la medición analítica de un certificado de análisis, pero a mayor escala y orientada a recoger material en lugar de medirlo. Las fracciones que salen de la columna se miden, y solo se reúnen las fracciones que cumplen la especificación. La solución reunida pasa después al liofilizador. Por qué los péptidos se envían secos y qué ocurre durante la liofilización se explica en ¿Por qué liofilizar?

Contraiones

Un péptido con cadenas laterales cargadas sale de la purificación como sal. El contraion procede de los ácidos utilizados durante la escisión y en la columna, normalmente ácido trifluoroacético: el polvo es entonces una sal de TFA. Un paso adicional, el intercambio iónico, sustituye ese contraion, por ejemplo por acetato. El catálogo contiene un ejemplo claro: PubChem tiene un registro propio para el acetato de oxitocina (CID 12004215) con un peso molecular de 1067,2, frente a 1007,2 del propio péptido. Esa diferencia de unos 60 es el acetato, y forma parte del peso del polvo. Por eso el contenido de péptido de un vial siempre es inferior al 100 %.

Péptidos largos o modificados

Cuanto más larga es la cadena, más rondas y más margen para acoplamientos incompletos; la revisión cita expresamente los péptidos largos como un caso difícil. Los bloques de construcción fuera del conjunto estándar también exigen trabajo adicional. Según PubChem, ipamorelin contiene ácido 2-aminoisobutírico y D-2-naftilalanina, dos aminoácidos que no aparecen en el código genético. Y un péptido puede modificarse después de la síntesis: PubChem describe CJC-1295 con DAC como un derivado maleimido de hGRF(1-29), es decir, la misma cadena con un grupo adicional unido.

Controles finales

Dos mediciones cierran el proceso. La HPLC analítica da la pureza como la proporción del pico principal, y la espectrometría de masas confirma la identidad comparando la masa medida con la calculada. Ambas deben figurar en el certificado, con el número de lote y la fecha. Qué controles ha realizado PulseChem por lote se expone en la página Estándar de laboratorio; cómo evaluar a un proveedor con ellos se trata en Cómo elegir un proveedor fiable.

Fuentes

Consultadas en noviembre de 2026.

Este artículo contiene información de contexto sobre la investigación de laboratorio. No es asesoramiento médico ni son instrucciones de uso. Todos los productos son exclusivamente para investigación.

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