Presque tous les peptides de recherche sont fournis sous forme de poudre sèche dans un flacon en verre. Cette poudre est lyophilisée, c’est-à-dire séchée par congélation. La raison est simple : un peptide s’altère dans l’eau, mais pratiquement pas à l’état sec.
Ce qui pose problème en solution
L’eau rend possibles un certain nombre de réactions de dégradation :
- Hydrolyse. La liaison entre deux acides aminés se rompt et la chaîne se fragmente.
- Oxydation. Ce sont surtout la méthionine, la cystéine et le tryptophane qui réagissent avec l’oxygène.
- Désamidation. L’asparagine et la glutamine perdent un groupe amide, ce qui modifie la charge du peptide.
- Agrégation. Les chaînes s’agglomèrent et précipitent.
La vitesse à laquelle cela se produit dépend de la séquence, du pH et de la température. Dans une poudre sèche, ces réactions sont quasiment à l’arrêt.
La cryodessiccation en trois étapes
- Congélation. La solution de peptide est congelée. L’eau se transforme en glace.
- Dessiccation primaire. Sous vide, la glace passe directement à l’état de vapeur, sans fondre au préalable. Ce phénomène s’appelle la sublimation.
- Dessiccation secondaire. La température est légèrement relevée pour éliminer l’eau liée restante.
Comme le produit n’est jamais à la fois liquide et chaud, la structure du peptide demeure intacte. Il reste un gâteau léger et poreux, ou une fine couche au fond du flacon.
À quoi ressemble la poudre
Quelques milligrammes de peptide représentent très peu de matière. Le flacon peut sembler presque vide, ou la poudre peut former un mince film contre le verre. Le gâteau peut aussi se détacher ou s’effriter pendant le transport. Rien de tout cela ne renseigne sur la qualité. La quantité et la pureté sont indiquées sur le certificat d’analyse.
Conservation
Un produit lyophilisé a trois ennemis : l’humidité, la chaleur et la lumière.
- Conservez le flacon fermé, au frais et à l’abri de la lumière. Respectez la température de conservation indiquée sur l’étiquette.
- Laissez un flacon froid revenir à température ambiante avant de l’ouvrir. Sinon, l’humidité de l’air se condense sur la poudre.
- Évitez les réchauffements et les refroidissements répétés.
La poudre attire l’eau. Moins un flacon reste ouvert longtemps, mieux cela vaut.
Et ensuite ?
Dès qu’un peptide est dissous, les réactions de dégradation décrites ci-dessus entrent de nouveau en jeu. La durée pendant laquelle une solution reste utilisable dépend du composé et du solvant. Consignez dans votre protocole quand une solution a été préparée et comment elle a été conservée, afin que les mesures puissent être retracées par la suite.
Vous trouverez d’autres termes de cet article dans le glossaire.
Pour approfondir la conservation, les voies de dégradation par acide aminé et la réception d’un envoi, voir Conserver les peptides au laboratoire.
Cet article fournit des informations générales sur la recherche en laboratoire. Il ne s’agit ni d’un avis médical ni d’un mode d’emploi. Tous les produits sont destinés exclusivement à la recherche.