Σχεδόν κάθε ερευνητικό πεπτίδιο παρέχεται ως ξηρή σκόνη σε γυάλινο φιαλίδιο. Η σκόνη αυτή είναι λυοφιλοποιημένη, δηλαδή ξηραμένη με ψύξη. Ο λόγος είναι απλός: ένα πεπτίδιο αλλοιώνεται μέσα στο νερό, ενώ σε ξηρή κατάσταση σχεδόν καθόλου.
Τι πηγαίνει στραβά σε διάλυμα
Το νερό καθιστά δυνατές ορισμένες αντιδράσεις αποικοδόμησης:
- Υδρόλυση. Ο δεσμός μεταξύ δύο αμινοξέων σπάει και η αλυσίδα διασπάται.
- Οξείδωση. Κυρίως η μεθειονίνη, η κυστεΐνη και η τρυπτοφάνη αντιδρούν με το οξυγόνο.
- Απαμίδωση. Η ασπαραγίνη και η γλουταμίνη χάνουν μια αμιδική ομάδα, γεγονός που μεταβάλλει το φορτίο του πεπτιδίου.
- Συσσωμάτωση. Οι αλυσίδες συσσωματώνονται και καθιζάνουν.
Το πόσο γρήγορα συμβαίνει αυτό εξαρτάται από την αλληλουχία, το pH και τη θερμοκρασία. Σε μια ξηρή σκόνη οι αντιδράσεις αυτές σχεδόν σταματούν.
Η λυοφιλοποίηση σε τρία βήματα
- Κατάψυξη. Το διάλυμα του πεπτιδίου καταψύχεται. Το νερό μετατρέπεται σε πάγο.
- Πρωτογενής ξήρανση. Υπό κενό, ο πάγος μετατρέπεται απευθείας σε ατμό χωρίς να λιώσει πρώτα. Αυτό ονομάζεται εξάχνωση.
- Δευτερογενής ξήρανση. Η θερμοκρασία αυξάνεται ελαφρά, ώστε να απομακρυνθεί και το τελευταίο δεσμευμένο νερό.
Επειδή το υλικό δεν είναι ποτέ ταυτόχρονα υγρό και θερμό, η δομή του πεπτιδίου παραμένει ακέραιη. Αυτό που απομένει είναι ένα ελαφρύ, πορώδες συσσωμάτωμα (cake) ή ένα λεπτό στρώμα στον πυθμένα του φιαλιδίου.
Πώς φαίνεται η σκόνη
Λίγα χιλιοστόγραμμα πεπτιδίου είναι πολύ λίγο υλικό. Το φιαλίδιο μπορεί να φαίνεται σχεδόν άδειο ή η σκόνη να βρίσκεται ως λεπτή μεμβράνη πάνω στο γυαλί. Το συσσωμάτωμα μπορεί επίσης να αποκολληθεί ή να θρυμματιστεί κατά τη μεταφορά. Τίποτα από αυτά δεν λέει κάτι για την ποιότητα. Η ποσότητα και η καθαρότητα αναγράφονται στο πιστοποιητικό ανάλυσης.
Φύλαξη
Το λυοφιλοποιημένο υλικό έχει τρεις εχθρούς: την υγρασία, τη θερμότητα και το φως.
- Φυλάσσετε το φιαλίδιο κλειστό, σε δροσερό και σκοτεινό μέρος. Τηρείτε τη θερμοκρασία φύλαξης που αναγράφεται στην ετικέτα.
- Αφήστε ένα κρύο φιαλίδιο να φτάσει σε θερμοκρασία δωματίου πριν το ανοίξετε. Διαφορετικά, η υγρασία του αέρα συμπυκνώνεται πάνω στη σκόνη.
- Αποφεύγετε την επανειλημμένη θέρμανση και ψύξη.
Η σκόνη απορροφά νερό. Όσο λιγότερο μένει ανοιχτό ένα φιαλίδιο, τόσο το καλύτερο.
Και μετά;
Μόλις ένα πεπτίδιο διαλυθεί, οι αντιδράσεις αποικοδόμησης που περιγράφηκαν παραπάνω ισχύουν ξανά. Το πόσο καιρό παραμένει χρησιμοποιήσιμο ένα διάλυμα εξαρτάται από την ένωση και τον διαλύτη. Καταγράφετε στο εργαστηριακό σας ημερολόγιο πότε παρασκευάστηκε ένα διάλυμα και πώς φυλάχθηκε, ώστε οι μετρήσεις να μπορούν αργότερα να αναχθούν σε αυτό.
Περισσότερους όρους από αυτό το άρθρο θα βρείτε στο γλωσσάριο.
Για μια πιο αναλυτική ματιά στη φύλαξη, στις οδούς αποικοδόμησης ανά αμινοξύ και στην παραλαβή μιας αποστολής, δείτε το άρθρο Φύλαξη πεπτιδίων στο εργαστήριο.
Το άρθρο αυτό παρέχει πληροφορίες υποβάθρου για την εργαστηριακή έρευνα. Δεν αποτελεί ιατρική συμβουλή ούτε οδηγίες χρήσης. Όλα τα προϊόντα προορίζονται αποκλειστικά για ερευνητική χρήση.